
Verdrogingsproblemen spelen in landbouwgebieden en natuurgebieden. Met name in de zomer zakken de waterstanden te diep weg, waardoor landbouwgewassen en natuur verdrogen. Voor dit probleem zijn samenhangende maatregelen nodig in het hele watersysteem.
In de agrarische gebieden wordt droogteschade tegengegaan door het vertragen van de afvoer van water in het voorjaar en door de aanvulling van het grondwater door waterconservering. Het waterschap stelt zich tot doel om de verdroging aan te pakken van de meest verdroogde landbouwgebieden. Realisatie vindt vooral plaats door deel te nemen in LandbouwOntwikkelingsPlannen (LOP's). In dit kader zijn de afgelopen jaren circa 600 stuwtjes geplaatst in kleinere watergangen. Waterconservering is vooral effectief en kansrijk in de kleine watergangen. Grootschalige aanpak draagt tevens bij aan een vermindering van de piekafvoeren.
Verdroogde natuurgebieden staan in een Meerjarenprogramma verdrogingsbestrijding en worden door het waterschap onderzocht. Om de landelijke en provinciale doelstellingen te bereiken, moet in 2010 de verdrogingsproblematiek zijn opgelost in 32 natuurgebieden in het beheergebied van Waterschap De Dommel. Tot nu toe is de verdroging in 8 gebieden aangepakt, waaronder de Cartierheide, het Plateaux, het Zwartven en de Tongelreep bij de Achelse Kluis. De komende jaren wordt uitvoering gegeven aan de projecten de Pan, Tongelreep bij de visvijvers, de Brand, Strabrechtse Heide en het Bossche Broek.
Om (verdergaande) verdroging van natuurgebieden te voorkomen, geldt een beschermingsbeleid rondom natuurgebieden. Dit beleid schrijft voor dat voor ingrepen in de waterhuishouding (bijvoorbeeld drainages) een vergunning nodig is. Dit beleid is vastgelegd in de Keur met bijbehorende beleidsregels (januari 1998).
Door het rijk is aan de provincies en waterschappen gevraagd het Gewenste Grond- en OppervlaktewaterRegime (GGOR) uit te werken. Het GGOR is een set van kaarten waarop te realiseren en te behouden grondwaterstanden en oppervlaktewaterpeilen staan aangegeven. De provincie Noord-Brabant stelt voor 1 januari 2005 de GGOR op beleidsniveau vast. Aansluitend start het waterschap met de uitwerking van de GGOR op perceelsniveau.